Ascalaph Designer

Deskrizzjoni

Ascalaph Designer huwa programm għal skopijiet ġenerali għal simulazzjonijiet dinamiċi molekulari. Taħt ambjent grafiku wieħed huma rappreżentati bħala l-implimentazzjoni tagħhom stess ta 'dinamika molekulari kif ukoll il-metodi ta' mekkanika klassika u kwantistika ta 'programmi popolari. Il-karatteristiċi jinkludu grafika molekulari: twieqi multipli, żewġ kameras għal kull mudell, CPK, qafas tal-Wajer, Stick, Ball u Stick, u stili CPK Wire frame, bini ta 'mudell molekulari: bennej tal-kristall, bennej tal-katina, tpinġija bil-maws, editjar tal-ġeometrija molekulari, ottimizzazzjoni preliminari , ottimizzazzjoni quantum, u tneħħija ta 'kunflitti, ottimizzazzjoni tal-ġeometrija molekulari b'metodi ta' gradjent konjugat, dinamika molekulari: integrazzjoni ta 'pass ta' ħin multipli, integrazzjoni tar-raba 'ordni, kalkoli ta' superkompjuter bl-għajnuna ta 'MDynaMix, mudell tal-ilma SPC flessibbli, u mudell tal-ilma impliċitu, u kimika kwantistika bl-għajnuna ta' CP2K u PC GAMESS/Firefly: enerġija, ottimizzazzjoni tal-ġeometrija molekulari, u ħlasijiet potenzjali derivati.