CodonCode Aligner

Deskrizzjoni

CodonCode Aligner huwa softwer faċli għall-utent għall-assemblaġġ tas-sekwenza tad-DNA, l-allinjament, l-editjar tal-kontig, u l-iskoperta tal-mutazzjoni. Aligner huwa kompatibbli ma ' Phred-Phrap u jappoġġja bis-sħiħ il-punteġġi tal-kwalità tas-sekwenza, filwaqt li joffri interface tal-utent familjari u faċli biex titgħallem. Il-karatteristiċi jinkludu sekwenzi ta' importazzjoni minn fajls ta' test, jallinjaw kontigs ma' xulxin filwaqt li jżommu r-rabtiet mat-traċċi, isibu mutazzjonijiet eterozigoti, jiddefinixxu reġjuni ta' interess ("karatteristiċi"), jimportaw u jeditjaw assemblaġġi ġenerati minn Phrap, jesporta sekwenzi u karatteristiċi, jimporta sekwenzi minn fajls ABI u SCF, trim tal-vettur, tallinja ma 'sekwenza ta' referenza, tanalizza inserzjonijiet u tħassir eterozigoti, naviga bejn karatteristiċi definiti mill-utent, u esporta proġetti ta 'assemblaġġ kompatibbli ma' Consed.