GATE

Deskrizzjoni

GATE (Grid Analiżi ta 'Time-Series Expression) hija pjattaforma ta' softwer komputazzjonali integrata għall-analiżi u l-viżwalizzazzjoni ta 'serje ta' ħin bijo-molekulari ta 'dimensjoni għolja. GATE juża algoritmu ta' raggruppament ibbażat fuq korrelazzjoni biex jirranġa serje ta' ħin molekulari fuq firxa eżagonali bidimensjonali u ikkulurit b'mod dinamiku ħeksagoni individwali skont il-livell ta' espressjoni tal-komponent molekulari li għalih huma assenjati, biex toħloq films animati ta' livell molekulari ta' sistemi. dinamika regolatorja. Sabiex jiġu dedotti mekkaniżmi ta 'kontroll regolatorju potenzjali minn mudelli ta' korrelazzjoni, GATE jippermetti wkoll interrogazzjoni interattiva ta 'films kontra varjetà wiesgħa ta' settijiet ta 'dejta ta' għarfien minn qabel. Il-films GATE jistgħu jitwaqqfu u huma interattivi, li jippermettu lill-utenti jibnu mill-ġdid in-netwerks u jwettqu analiżi ta 'arrikkiment funzjonali. Films maħluqa b'GATE jistgħu jiġu ssejvjati f'format Flash u jiddaħħlu direttament f'fajls manuskritti PDF bħala figuri interattivi.