MultiGeneBlast

Deskrizzjoni

MultiGeneBlast hija għodda ta 'sors miftuħ ibbażata fuq ifformattjar mill-ġdid tal-headers FASTA tal-entrati tal-proteini NCBI GenBank, li jużaha jista' jsegwi n-nukleotide u l-koordinati tas-sors tagħhom. MultiGeneBlast jista 'jgħin fl-iskoperta ta' tali partijiet multiġene għal proġetti ta 'bijoloġija sintetika. Librerija sintetika ta 'operons tista' tinħoloq ibbażata fuq l-output tagħha biex tidentifika dawk l-operons li l-funzjoni tagħhom hija l-eqreb għal dik mixtieqa mill-utent. Din l-għodda tipprovdi l-opportunitajiet biex jiġu identifikati r-reġjuni ġenomiċi omologi kollha billi tgħaqqad ir-riżultati ta 'ġirjiet BlastP waħdieni fuq kull ġene, u tissortja reġjuni ġenomiċi minn kwalunkwe dħul GenBank bin-numru ta' hits, konservazzjoni ta 'sintenija u punteġġ kumulattiv tal-Blast bit. Jistgħu jsiru tfittxijiet fl-arkitettura biex jinstabu xi reġjuni ġenomiċi b'blast hits għal kwalunkwe kombinazzjoni speċifikata mill-utent ta' sekwenzi ta' amino acid.