GenoSuite

Deskrizzjoni

GenoSuite huwa qafas żviluppat għall-analiżi proteoġenomika. L-istrateġija bbażata fuq FDRScore tintuża biex tintegra r-riżultati minn algoritmi ta' tfittxija multipli. Għodda Proteoġenomika Prokarjotika (PPT) hija żviluppata bħala parti mill-qafas GenoSuite. PPT huwa biex jinstabu traduzzjonijiet ġodda fil-ġenomi prokarjotiċi u huwa dipendenti fuq data proteomika bbażata fuq Spettrometrija tal-Massa u sekwenza tal-ġenoma relatata. Il-karatteristiċi jinkludu kkonfigurati għal 4 algoritmi ta' sors miftuħ biex iwettqu t-tiftix tad-database għall-identifikazzjoni tal-peptidi u tista' tintgħażel kwalunkwe kombinazzjoni tal-4 algoritmi, telenka l-peptidi speċifiċi tat-tfittxija tal-ġenoma (peptidi ġodda), logħbiet spettrali jistgħu jiġu viżwalizzati għall-valutazzjoni tal-kwalità, jelenka barra il-proteini ġodda u l-bidliet fl-annotazzjonijiet tal-proteini eżistenti, u kuntest ġenomic viżwali tal-peptidi ġodda jistgħu wkoll jiġu ġġenerati.