codonPhyML

Deskrizzjoni

codonPhyML juża mudelli tal-kodon Markovjan ta 'evoluzzjoni fir-rikostruzzjoni tal-filoġenija. Minħabba sett ta 'speċi kkaratterizzati mis-sekwenzi tad-DNA tagħhom bħala input, codonPhyML se jirritorna s-siġra filoġenetika li tiddeskrivi l-aħjar ir-relazzjoni evoluttiva tagħhom. Hija karatteristiċi euristiċi tat-tiftix tat-topoloġija tas-siġar NNI u SPR, parametri tar-rata ta 'sostituzzjoni stmati bil-probabbiltà massima, u appoġġ multicore permezz ta' OpenMP.